Nelle tecniche di biomonitoraggio della qualità dell'acqua vi sono:
- test di tossicità per misurazioni sulle risposte biomolecolari e fisiologiche di organismi nei confronti di tossici in situazioni sperimentali, compresi biosaggi e sistemi di controllo (tossicità acuta, tossicità cronica, genotossicità, bioaccumulazione e biomagnificazione);
- monitoraggio degli ecosistemi per misure sull'integrità di ecosistemi sottoposti a perturbazioni ambientali.
Tutti i metodi di monitoraggio per la valutazione della struttura di un ecosistema si traducono in campionamenti di specifici gruppi di biota.
L’indagine fornisce:
- indici per specie indicatrici,
- indici di ricchezza,
- indici di abbondanza,
- indici di diversità,
- indici biotici.
